Teadustöö | Tartu Ülikooli bio- ja siirdemeditsiini instituut

TÜ üksuste kontaktandmed

humanitaarteaduste ja kunstide valdkond
Faculty phone: 
737 5341
Faculty address: 
Jakobi 2, ruumid 116–121, 51014 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5341
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 116–121, 51005 Tartu
  • ajaloo ja arheoloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5651
    Faculty address: 
    Jakobi 2, 51005 Tartu
  • eesti ja üldkeeleteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5221
    Faculty address: 
    Jakobi 2, IV korrus, 51005 Tartu
  • filosoofia ja semiootika instituut
    Faculty phone: 
    737 5314
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 309–352, 51005 Tartu
  • kultuuriteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5223
    Faculty address: 
    Ülikooli 16, 51003 Tartu
  • maailma keelte ja kultuuride kolledž
    Faculty address: 
    Lossi 3, 51003 Tartu
  • usuteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5300
    Faculty address: 
    Ülikooli 18-310, 50090 Tartu
  • Viljandi kultuuriakadeemia
    Faculty phone: 
    435 5232
    Faculty address: 
    Posti 1, 71004 Viljandi
sotsiaalteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5957
Faculty address: 
Lossi 36, 51003 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5900
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • haridusteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 6440
    Faculty address: 
    Salme 1a–29, 50103 Tartu
  • Johan Skytte poliitikauuringute instituut
    Faculty phone: 
    737 5582
    Faculty address: 
    Lossi 36–301, 51003 Tartu
  • majandusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 6310
    Faculty address: 
    J. Liivi 4, 50409 Tartu
  • psühholoogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5902
    Faculty address: 
    Näituse 2, 50409 Tartu
  • õigusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5390
    Faculty address: 
    Näituse 20–324, 50409 Tartu
  • ühiskonnateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5188
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • Narva kolledž
    Faculty phone: 
    740 1900
    Faculty address: 
    Raekoja plats 2, 20307 Narva
  • Pärnu kolledž
    Faculty phone: 
    445 0520
    Faculty address: 
    Ringi 35, 80012 Pärnu
meditsiiniteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5326
Faculty address: 
Ravila 19, 50411 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5326
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • bio- ja siirdemeditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 4210
    Faculty address: 
    Biomeedikum, Ravila 19, 50411 Tartu
  • farmaatsia instituut
    Faculty phone: 
    737 5286
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • hambaarstiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    731 9856
    Faculty address: 
    Raekoja plats 6, 51003 Tartu
  • kliinilise meditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 5323
    Faculty address: 
    L. Puusepa 8, 50406 Tartu
  • peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituut
    Faculty phone: 
    737 4190
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • sporditeaduste ja füsioteraapia instituut
    Faculty phone: 
    737 5360
    Faculty address: 
    Jakobi 5–205, 51005 Tartu
loodus- ja täppisteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5820
Faculty address: 
Vanemuise 46–208, 51005 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5820
    Faculty address: 
    Vanemuise 46–208, 51005 Tartu
  • arvutiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5445
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • Eesti mereinstituut
    Faculty phone: 
    671 8902
    Faculty address: 
    Mäealuse 14, 12618 Tallinn
  • füüsika instituut
    Faculty address: 
    W. Ostwaldi 1, 50411 Tartu
  • keemia instituut
    Faculty phone: 
    737 5261
    Faculty address: 
    Ravila 14a, 50411 Tartu
  • matemaatika ja statistika instituut
    Faculty phone: 
    737 5860
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5011
    Faculty address: 
    Riia 23, 23b–134, 51010 Tartu
  • Tartu observatoorium
    Faculty phone: 
    737 4510
    Faculty address: 
    Observatooriumi 1, Tõravere, 61602 Tartumaa
  • tehnoloogiainstituut
    Faculty phone: 
    737 4800
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • ökoloogia ja maateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5835
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Asutused
  • raamatukogu
    Faculty phone: 
    737 5702
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • teaduskool
    Faculty phone: 
    737 5581
    Faculty address: 
    Uppsala 10, 51003 Tartu
  • genoomika instituut
    Faculty phone: 
    737 4000
    Faculty address: 
    Riia 23b, 51010 Tartu
  • muuseum
    Faculty phone: 
    737 5674
    Faculty address: 
    Lossi 25, 51003 Tartu
  • loodusmuuseum ja botaanikaaed
    Faculty phone: 
    737 6076
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Tugiüksused
  • ettevõtlus- ja innovatsioonikeskus
    Faculty phone: 
    737 6339
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • grandikeskus
    Faculty phone: 
    737 6215
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • hankeosakond
    Faculty phone: 
    737 6632
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • infotehnoloogia osakond
    Faculty phone: 
    737 6000, arvutiabi: 737 5500
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kantselei
    Faculty phone: 
    737 5606
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kinnisvaraosakond
    Faculty phone: 
    737 5137
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • personaliosakond
    Faculty phone: 
    737 5145
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 302 ja 304, 50090 Tartu
  • rahandusosakond
    Faculty phone: 
    737 5125
    Faculty address: 
    Jakobi 4, 51005 Tartu
  • rektoraadi büroo
    Faculty phone: 
    737 5600
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 51014 Tartu
  • siseauditi büroo
    Faculty address: 
    Ülikooli 17–103, 51005 Tartu
  • Tallinna esindus
    Faculty phone: 
    737 6600
    Faculty address: 
    Teatri väljak 3, 10143 Tallinn
  • turundus- ja kommunikatsiooniosakond
    Faculty phone: 
    737 5687
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 102, 104, 209, 210, 50090 Tartu
  • õppeosakond
    Faculty phone: 
    737 5620
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 50090 Tartu
  • üliõpilasesindus
    Faculty phone: 
    737 5400
    Faculty address: 
    Ülikooli 18b, 51005 Tartu
Muud üksused
  • MTÜ Tartu Ülikooli Akadeemiline Spordiklubi
    Faculty phone: 
    737 5371
    Faculty address: 
    Ujula 4, 51008 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasküla
    Faculty phone: 
    740 9959
    Faculty address: 
    Narva mnt 25, 51013 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasmaja
    Faculty phone: 
    730 2400
    Faculty address: 
    Kalevi 24, Tartu
  • OÜ Tartu Ülikooli Kirjastus
    Faculty phone: 
    737 5945
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • SA Tartu Ülikooli Kliinikum
    Faculty phone: 
    731 8111
    Faculty address: 
    L. Puusepa 1a, 50406 Tartu
  • Tartu Ülikooli Sihtasutus
    Faculty phone: 
    737 5852
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a–106, Tartu

TÜ üksuste kontaktandmed

humanitaarteaduste ja kunstide valdkond
Faculty phone: 
737 5341
Faculty address: 
Jakobi 2, ruumid 116–121, 51014 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5341
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 116–121, 51005 Tartu
  • ajaloo ja arheoloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5651
    Faculty address: 
    Jakobi 2, 51005 Tartu
  • eesti ja üldkeeleteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5221
    Faculty address: 
    Jakobi 2, IV korrus, 51005 Tartu
  • filosoofia ja semiootika instituut
    Faculty phone: 
    737 5314
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 309–352, 51005 Tartu
  • kultuuriteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5223
    Faculty address: 
    Ülikooli 16, 51003 Tartu
  • maailma keelte ja kultuuride kolledž
    Faculty address: 
    Lossi 3, 51003 Tartu
  • usuteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5300
    Faculty address: 
    Ülikooli 18-310, 50090 Tartu
  • Viljandi kultuuriakadeemia
    Faculty phone: 
    435 5232
    Faculty address: 
    Posti 1, 71004 Viljandi
sotsiaalteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5957
Faculty address: 
Lossi 36, 51003 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5900
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • haridusteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 6440
    Faculty address: 
    Salme 1a–29, 50103 Tartu
  • Johan Skytte poliitikauuringute instituut
    Faculty phone: 
    737 5582
    Faculty address: 
    Lossi 36–301, 51003 Tartu
  • majandusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 6310
    Faculty address: 
    J. Liivi 4, 50409 Tartu
  • psühholoogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5902
    Faculty address: 
    Näituse 2, 50409 Tartu
  • õigusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5390
    Faculty address: 
    Näituse 20–324, 50409 Tartu
  • ühiskonnateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5188
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • Narva kolledž
    Faculty phone: 
    740 1900
    Faculty address: 
    Raekoja plats 2, 20307 Narva
  • Pärnu kolledž
    Faculty phone: 
    445 0520
    Faculty address: 
    Ringi 35, 80012 Pärnu
meditsiiniteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5326
Faculty address: 
Ravila 19, 50411 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5326
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • bio- ja siirdemeditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 4210
    Faculty address: 
    Biomeedikum, Ravila 19, 50411 Tartu
  • farmaatsia instituut
    Faculty phone: 
    737 5286
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • hambaarstiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    731 9856
    Faculty address: 
    Raekoja plats 6, 51003 Tartu
  • kliinilise meditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 5323
    Faculty address: 
    L. Puusepa 8, 50406 Tartu
  • peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituut
    Faculty phone: 
    737 4190
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • sporditeaduste ja füsioteraapia instituut
    Faculty phone: 
    737 5360
    Faculty address: 
    Jakobi 5–205, 51005 Tartu
loodus- ja täppisteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5820
Faculty address: 
Vanemuise 46–208, 51005 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5820
    Faculty address: 
    Vanemuise 46–208, 51005 Tartu
  • arvutiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5445
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • Eesti mereinstituut
    Faculty phone: 
    671 8902
    Faculty address: 
    Mäealuse 14, 12618 Tallinn
  • füüsika instituut
    Faculty address: 
    W. Ostwaldi 1, 50411 Tartu
  • keemia instituut
    Faculty phone: 
    737 5261
    Faculty address: 
    Ravila 14a, 50411 Tartu
  • matemaatika ja statistika instituut
    Faculty phone: 
    737 5860
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5011
    Faculty address: 
    Riia 23, 23b–134, 51010 Tartu
  • Tartu observatoorium
    Faculty phone: 
    737 4510
    Faculty address: 
    Observatooriumi 1, Tõravere, 61602 Tartumaa
  • tehnoloogiainstituut
    Faculty phone: 
    737 4800
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • ökoloogia ja maateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5835
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Asutused
  • raamatukogu
    Faculty phone: 
    737 5702
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • teaduskool
    Faculty phone: 
    737 5581
    Faculty address: 
    Uppsala 10, 51003 Tartu
  • genoomika instituut
    Faculty phone: 
    737 4000
    Faculty address: 
    Riia 23b, 51010 Tartu
  • muuseum
    Faculty phone: 
    737 5674
    Faculty address: 
    Lossi 25, 51003 Tartu
  • loodusmuuseum ja botaanikaaed
    Faculty phone: 
    737 6076
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Tugiüksused
  • ettevõtlus- ja innovatsioonikeskus
    Faculty phone: 
    737 6339
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • grandikeskus
    Faculty phone: 
    737 6215
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • hankeosakond
    Faculty phone: 
    737 6632
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • infotehnoloogia osakond
    Faculty phone: 
    737 6000, arvutiabi: 737 5500
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kantselei
    Faculty phone: 
    737 5606
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kinnisvaraosakond
    Faculty phone: 
    737 5137
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • personaliosakond
    Faculty phone: 
    737 5145
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 302 ja 304, 50090 Tartu
  • rahandusosakond
    Faculty phone: 
    737 5125
    Faculty address: 
    Jakobi 4, 51005 Tartu
  • rektoraadi büroo
    Faculty phone: 
    737 5600
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 51014 Tartu
  • siseauditi büroo
    Faculty address: 
    Ülikooli 17–103, 51005 Tartu
  • Tallinna esindus
    Faculty phone: 
    737 6600
    Faculty address: 
    Teatri väljak 3, 10143 Tallinn
  • turundus- ja kommunikatsiooniosakond
    Faculty phone: 
    737 5687
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 102, 104, 209, 210, 50090 Tartu
  • õppeosakond
    Faculty phone: 
    737 5620
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 50090 Tartu
  • üliõpilasesindus
    Faculty phone: 
    737 5400
    Faculty address: 
    Ülikooli 18b, 51005 Tartu
Muud üksused
  • MTÜ Tartu Ülikooli Akadeemiline Spordiklubi
    Faculty phone: 
    737 5371
    Faculty address: 
    Ujula 4, 51008 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasküla
    Faculty phone: 
    740 9959
    Faculty address: 
    Narva mnt 25, 51013 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasmaja
    Faculty phone: 
    730 2400
    Faculty address: 
    Kalevi 24, Tartu
  • OÜ Tartu Ülikooli Kirjastus
    Faculty phone: 
    737 5945
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • SA Tartu Ülikooli Kliinikum
    Faculty phone: 
    731 8111
    Faculty address: 
    L. Puusepa 1a, 50406 Tartu
  • Tartu Ülikooli Sihtasutus
    Faculty phone: 
    737 5852
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a–106, Tartu

Teadustöö

Teadustöö põhisuundadeks on muskuloskeletaalsete haiguste patogeneesi uurimine, krooniliste põletikuliste protsesside ja degeneratiivsete haiguste uurimine. Selgitatakse välja ning täpsustatakse, südamepuudulikkuse ja vananemisega kaasneva sarkopeenia bioenergeetilisi ning patofüsioloogilisi aluseid. Seoses sellega analüüsitakse glükolüüsi ja oksüdatiivse fosforüülimise interaktsioonimehhanisme ning mitokondrite ja ATPaaside vahelisi funktsionaalseid komplekse lihasrakkudes ning kirjeldadatakse nende muutusi erinevates patofüsioloogilistes tingimustes (kodade dilatatsioon, põletik, ER stress). Bioenergeetiliste muutuste osakaalu täpsemaks määratlemiseks sarkopeenia tekkeprotsessis, uuritakse energeetilise metabolismi, diferentseerumimarkerite ekspressiooni ja signaalsüsteemide aktivatsiooni vahelisi seoseid.

Varasemates töödes on uuritud oksüdatiivse fosforüülimise regulatsioonimehhanismide muutusi mitokondritevälise kaltsiumi toimel aju mitokondrites ning energeetilise metabolismi remodelleerumisprotsesse mahu ülekoormusest tingitud kodade laienemise korral. Veel oleme leidnud, et vananevatele lihastele on iseloomulik regeneratiivse potentsiaali vähenemine, mis sisaldab endas energeetilise metabolismi kahjustuse komponenti, müoblastide suurenenud vastuvõtlikkust hüpoksiast ja kaltsiumi ülekoormusest tingitud kahjustusele ning rakkude vähenenud diferentseerumisvõimet.

Teadustöö käigus kombineerime süsteemigeneetika andmeid fokuseeritud uuringutega rakkude bioenergeetikast ja ER stressist. Käimasolevad projektid on järgnevad:
- energeetilise metabolismi uurimine südamelihases, skeletilihases ja ajukoes südamepuudulikkuse, neurodegeneratiivsete haiguste ja vananemise tingimustes;
- geneetiliste tegurite analüüs luu ja liigeste haiguste (osteoporoos, osteoartriit, Osteogenesis Imperfecta) patogeneesis;
- haruldaste haiguste geneetilised uuringud;
- psoriaasi patogeneesis uute geneetiliste tegurite otsimine ja kirjeldamine;
- Parkinsoni tõve (PD) geneetilise arhitektuuri selgitamine ja geneetiliste tegurite roll PD patogeneesis;
- geneetiliste tegurite uurimine sportlaste sooritusvõimes ja vigastusriski tekkimises;
- patoloogiliste protsesside kirjeldamiseks ja uuringuteks on rajatud haiguspõhine biopank.

Teadussuundade elluviimiseks on patofüsioloogia osakonnas olemas kompetents rakkude energeetilise metabolisimi uurimiseks, haigusmudelite uurimiseks, genoomika uuringuteks (genotüpeerimine, RNAseq, eksoomide ja genoomide sekveneerimine), inimuuringute läbiviimiseks, haigusspetsiifiline biopank ning põhjalikuks andmeanalüüsiks.

Joonis 1. Skeem muskuloskeletaalsete haiguste siirdeuuringute eesmärkidest, tehnoloogiatest ja erinevatest uurimissuundadest.

 

Projektid

IUT20-46  01.01.2014–31.12.2019
Luu- ja lihaspatoloogiate siirdeuuringud
Vastuatav täitja: Sulev Kõks
Luu- ja lihaskonna haigused on üks suuremaid haiguste rühmasid ning neist on tingitud oluline ühiskonna haiguskoormus. Kuna haigused on kõrge levimusega just vanema elanikkonna hulgas, on nende roll eriti oluline riikides kus elanikkond vananeb. Vaatamata selle haigusrühma olulisusele, on meie teadmised nende patogeneesist piiratud ning nende haiguste ravi ja profülaktika ei ole ideaalsed. Uuritavate haiguste patogeneesi paremaks mõistmiseks on vaja rakendada siirdemeditsiinilist lähenemist. Meie uuringute üldiseks eesmärgiks on kirjeldada uusi patogeneetilisi radasid (energeetiline metabolism, ER stress) ning avastada uusi geneetilisi võrgustikke, mis osalevad nende haiguste tekkes. Me jätkame praegu käimasolevaid uuringuid vananeva skeleti- ja südamelihase bioenergeetika alal. Lisaks hakkame uurima peamisi luu ja liigeste haigusi (osteoporoos, osteoartriit). Oma uuringute käigus kombineerime süsteemigeneetikat fokuseeritud uuringutega rakkude bioenergeetikast ja ER stressist.

Euroopa komisjoni 7. Raamprogrammi Projekt MARTO13136R 01.08.2013–31.07.2018 www.hyporth.eu
HypOrth - Uus lähenemine hüpoallergilise implantaadi materjali arendamiseks ortopeedias. Sammud personaalse meditsiini suunas
Vastutav täitja: Aare Märtson, Sulev Kõks
Projekti eesmärgiks on selgitada endoproteeside hilistüsistuste tekkemehhanisme, analüüsida erinevate materjalide mõju hilistüsistuste tekkimisele ning selle alusel töötada välja optimaalsemad materjalid proteesidele. Projekt kombineerib endas immunoloogia, genoomika, mikrobiologia, epidemioloogia, materjaliteadused ja kliinilise meditsiini. Projekti tulemusena saadakse terviklik ülevaade autoimmuuntekkelistest hilistest endoproteesitüsistustest. Tulemuste alusel soovitakse leida uusi biomarkereid et parandada varajast diagnostikat.

Sulev Kõksi ülevaade Biopangast (18.02.2014) ja teaduspõhisest spordist (17.04.2014). 

Eesti Teadusfondi projekt ETF8736 01.01.2011-31.12.2014
Raku energeetiline puudulikkus kui südame - ja skeletilihase haiguste alus ja kaitsemehhanismide sihtmärk.
Vastutav täitja: Enn Seppet/ Margus Eimre
Põhitäitjad: Kalju Paju, Ehte Orlova, Lumme Kadaja, Arno Ruusalepp, Taavi Põdramägi, Mart Roosimaa, Reedik Pääsuke, Andres Piirsoo, Tatjana Kums, Helena Gapeyeva, Mati Pääsuke
Projekt käsitleb mitmeid omavahel seotud aspekte energeetilise metabolismi häirete rollist südame ja skeletilihaste haiguste patogeneesis, nagu (i) oksüdatiivse fosforüülimise (OXPHOS) regulatsiooni muutused mitokondrivälise Ca2+ toimel ja (ii) OXPHOSi ja glükolüüsi seoste muutused hüpoksia, südamepuudulikkuse ja vananemisega kaasneva sarkopeenia korral. (iii) Uuritakse ka mõningate signaalsüsteemide (HIF-1alfa, p38, MEK/Erk, and PKB/Akt) võimet südamehaiguste kaitses ja sarkopeenia pidurdamisel.

Joonis 2. Mitokondriaalse ATP sünteesi ja energia ülekande häired põhjustavad rakkude energeetilist puudulikkust (CED) ja viivad lihase töövõime languseni. Tsütoplasmas suurenevad Ca2+ ja hapniku vabade radikaalide kontsentratsioonid, mis kahjustavad mitokondreid ja energiaülekannet veelgi ning põhjustavad rakkude surma. CK – energiaülekandes osalevad kreatiinkinaasi isoensüümid, AK – adenülaatkinaas, PK – püruvaatkinaas, HK II – heksokinaasi isoensüüm, mis võib energiapuuduse tingimustes seostuda mitokondriga, soodustades energiaproduktsiooni ja ülekannet kui adaptatsioonimehhanism. MOMP- mitokondri välismembraani permeabilisatsioon, PT – megakanal mitokondri sisemembraanis, Inhibiitorid – Bcl perekonna valgud ja tsüklosporiin A, mis hoiavad ära mitokondri membraanides kanalite tekke, Aralar – aspartaat/glutamaat transporter, malaat-aspartaat süstiku komponent, R.C. – hingamisahel.

Teaduse rahvusvahelistumise programm LARFS12124T 01.05.2012–31.08.2015
Eesti ja Vietnami koostöö meditsiiniteaduste valdkonnas
Vastutav täitja: Sulev Kõks
DIOXMED algatuse eesmärgiks on panna alus Eesti, Suurbritannia ja Vietnami riikidevahelisele teaduskoostööle ülikoolide ja kliinikute vahel teadvustamaks dioksiinide, kui keskkonna saasteainete poolt põhjustatud järjest suuremate probleemide mõju inimeste igapäevaelus (väärarengud, viljatus jm), veterinaariateaduses kui ümbritsevas keskkonnas. Projekti tegevuste raames arendatakse Eesti meditsiiniteadlaste teaduskoostööd rahvusvahelisel tasemel konkurentsivõime tõstmiseks luu ja liigesehaiguste ning reproduktiivmeditsiini valdkonnas suure kasvupotentsiaaliga Vietnamis. Mh tehakse aktiivset koostööd uute teadustööde algatamise nimel Vietnami meditsiinivaldkonna õppe- ja teadusasutustega (Hue University of Medicine and Pharmacy), Vietnami haiglatega (Hues, Da Nangis, Saigonis, Hanois), Geneetilise Konsultatsiooni ja Puuetega Laste Keskusega Vietnamis ja King’s College’ga Londonist.

Regeneratiivse meditsiini arendamise rahvusvaheline koostöö (REMARK) 01.05.2012–31.08.2015
Vastutav täitja: Eric Tkaczyk
Regeneratiivne meditsiin on tulevikutehnoloogia, millele Eestis on loodud tugev arengupotentsiaal. Saavutatut jätkates on hea perspektiiv maailma eesliiniteaduses tulemusi saavutada. Algatuse eesmärgiks on läbi rahvusvahelise koostöö tõsta Eesti regeneratiivse meditsiini alase uurimistöö kvaliteeti rahvusvaheliselt konkurentsivõimelisele tasemele. Teiseks eesmärgiks on eelduste loomine kõrget majanduslikku lisandväärtust loovate jätkusuutlike biomeditsiini ettevõtete tekkeks. Rahvusvahelist teaduskoostööd arendatakse järgmiste tegevustega:
- ühinetakse ja tehakse aktiivset koostööd regeneratiivse meditsiini rahvusvahelise konsortsiumiga RMC (The Regenerative Medicine Coalition); sõlmitakse individuaalseid koostöölepingudjuhtivate keskustega ja tipplaboratooriumitega;
- planeeritakse tulevikus toimuvat rahvusvahelist teaduskoostööd, valmistatakse ette ühisuuringuid ja tehakse vajalik eeltöö teadlasvahetuseks;
- planeeritakse detailselt Eesti laboratooriumite infrastruktuuri kaasajastamist, võimaldamaks osalemist suurtes rahvusvahelistes regeneratiivse meditsiini koostööprojektides. Tegevused on jaotatud kolme koostöövaldkonda, mis on kooskõlas arengukavaga Teadmistepõhine Eesti II, fokusseerides võtmetehnoloogiatele (biotehnoloogiad, materjalitehnoloogiad):
I. Rakukultuuride innovaatilised 3D mudelid ja meetodid materjaliteaduses
II. Mitteinvasiivsed kõrgtehnoloogilised kuvamistehnoloogiad ja optilised uurimismeetodid
III. Biopangandus, genoomika ja proteoomika.

Euroopa komisjoni 7. Raamprogrammi Projekt MARMP09022R 01.01.2009-30.06.2013
“MYOAGE – Eaga seotud lihasnõrkuse mehhanismid ja vältimine”.
Vastutav täitja: Enn Seppet/Mati Pääsuke
Põhitäitjad: Kalju Paju, Lumme Kadaja, Margus Eimre, Nadežda Peet, Merike Kruus, Jelena Sokk, Reedik Pääsuke, Mart Roosimaa, Helena Gapeyeva, Jaan Ereline, Tatjana Kums, Herje Aibast, Aare Märtson, Andres Piirsoo, Anu Kõiveer, Tauno Koovit.
Uuritakse east sõltuvaid muutusi mitokondrite hingamisahela komplekside talitluses ja funktsionaalsetes seostes mitokondriaalsete kinaaside ja oksüdatiivse fosforüülimise ning perifeersete kinaaside ja ATPaaside vahel, mitokondrite Ca2+ akumuleerimisvõimes, kinaaside, tsütoskeletivalkude ja lahutavate valkude ekspressioonis ning lihase kontraktiilses funktsioonis. Energeetilise metabolismi muutuste, diferentseerumismarkerite ekspressiooni ja signaalsüsteemide aktivatsiooni vahelisi seoseid uuritakse reie nelipea lihasbiopsiatest (m. quadriceps) kultiveeritud müoblastides. Hinnatakse oksüdatiivse fosforüülimise regulatsiooni muutusi mitokondrivälise Ca2+ toimel (glutamaat-aspartaadi transporteri: aralari vahendusel) ning registreeritakse oksüdatiivse fosforüülimise ja glükolüüsi seoste muutusi. Uuringus hinnatakse pro- ja antiinflammatoorsete tsütokiinide osa energeetilise metabolismi modulatsioonis. Viiakse läbi raku energeetilise metabolismiga seotud genoomi analüüs müotsüütides ja tüvirakkudes müogeneesi erinevatel astmetel.

Sihtfinantseeritav projekt SF0180114As08 01.01.2008-31.12.2013
Haridus- ja teadusministeeriumi sihtfinatseeritav projekt “Oksüdatiivse fosforüülimise ja energeetilise metabolismi kompartmentatsiooni häirete roll haigestunud ja vananenud lihasrakkude patofüsioloogias”.
Teema juht: Enn Seppet/Lumme Kadaja
Põhitäitjad: Margus Eimre, Lumme Kadaja, Ehte Orlova, Kalju Paju, Arno Ruusalepp, Evelin Seppet
Projekti eesmärgiks on uurida energeetilise metabolismi süsteemide (oksüdatiivne fosforüülimine ja energiaülekanne) südame- ja skeletilihastes südamepuudulikkuse, neurodegeneratiivsete haiguste ja vananemise tingimustes. Uuritakse mitokondrite hingamisahela komplekside talitlust ja funktsionaalseid seoseid mitokondriaalsete kinaaside ja oksüdatiivse fosforüülimise ning perifeerste kinaaside ja ATPaaside vahel seoses mitokondrite Ca2+ akumuleerimisvõimega ning kinaaside, tsütoskeletivalkude ja lahutavatae valkude ekspressiooniga ning lihase kontraktiilse funktsiooniga. Vananeva lihase uurimisel on erilise tähelepanu all mTOR- ja AMPK-vahendatud teede ning pro- ja antiinflammatoorsete tsütokiinide rollid rakusisese energeetilise metabolismi moduleerimisel.

Eesti Teadusfondi projekt ETF7823 01.01.2009-31.12.2012
Raku energiaühikute moodustumise dünaamika tüvirakkude diferentseerumise protsessis lihasrakkudeks ja nende degradatsioon vananemise käigus.
Vastutav täitja: Valdur Saks
Põhitäitjad: Ehte Orlova, Enn Seppet, Kalju Paju, Lumme Kadaja, Toomas Tiivel, Anu Nutt, Kairi Tammoja, Kersti Tepp, Tuuli Käämbre, Peeter Sikk, Madis Metsis, Natalja Timohhin, Andres Piirsoo, Karin Tamm, Minna Karu, Tiina Drell, Igor Ševtšuk, Vladimir Tšekulaje, Aleksandr Klepinin
Viiakse läbi mitokondrite ja tsütoskeleti valkude proteoomi ja genoomi analüüs müotsüütides ja tüvirakkudes müogeneesi erinevatel astmetel.
 

 

Peamised publikatsioonid

  1. Roosimaa M, Põdramägi T, Kadaja L, Ruusalepp A, Paju K, Puhke R, Eimre M, Orlova E, Piirsoo A, Peet N, Gellerich FN, Seppet E (2013). Dilation of human atria: Increased diffusion restrictions for ADP, overexpression of hexokinase 2 and its coupling to oxidative phosphorylation in cardiomyocytes. Mitochondrion. 13: 399-409.
  2. Kõks S, Overall RW, Ivask M, Soomets U, Guha M, Vasar E,  Fernandes C, Schalkwyk LC (2013). Silencing of the WFS1 gene in HEK cells induces pathways related to neurodegeneration and mitochondrial damage. Physiological genomics. 45: 182-190.
  3. Seppet E, Orlova E, Seene T, Gellerich FN (2012). Adaptation of cardiac and skeletal muscle mitochondria to endurance training: implications for cardiac protection. Ostadal B, Dhalla N.S (Toim.). Cardiac Adaptations (375–402). Springer.
  4. Ellinghaus D, Ellinghaus E, Nair RP, Stuart PE, Esko T, Metspalu A, Debrus S, Raelson JV, Tejasvi T, Belouchi M, West SL, Barker JN, Kõks S, Kingo K, Balschun T, Palmieri O, Annese V, Gieger C, Wichmann HE, Kabesch M, Trembath RC, Mathew CG, Abecasis GR, Weidinger S, Nikolaus S, Schreiber S, Elder JT, Weichenthal M, Nothnagel M, Franke A (2012). Combined Analysis of Genome-wide Association Studies for Crohn Disease and Psoriasis Identifies Seven Shared Susceptibility Loci. American Journal of Human Genetics. 6: 636-647.
  5. Gellerich FN, Gizatullina Z, Trumbekaite S, Korzeniewski B, Gaynutdinov T, Seppet E, Vielhaber S, Heinze HJ, Striggow F (2012). Cytosolic Ca2+ regulates the energization of isolated brain mitochondria by formation of pyruvate through the malate-aspartate shuttle. Biochem J. 443: 747–755.
  6. Tsoi LC, Spain SL, Knight J, Ellinghaus E, Stuart PE, Capon F, Ding J, Li Y, Tejasvi T, Gudjonsson JE, Kang HM, Allen MH, McManus R, Novelli G, Samuelsson L, Schalkwijk J, Ståhle M, Burden AD, Smith CH, Cork MJ, Estivill X, Bowcock AM, Krueger GG, Weger W, Worthington J, Tazi-Ahnini R, Nestle FO, Hayday A, Hoffmann P, Winkelmann J, Wijmenga C, Langford C, Edkins S, Andrews R, Blackburn H, Strange A, Band G, Pearson RD, Vukcevic D, Spencer CC, Deloukas P, Mrowietz U, Schreiber S, Weidinger S, Koks S, Kingo K, Esko T, Metspalu A, Lim HW, Voorhees JJ, Weichenthal M, Wichmann HE, Chandran V, Rosen CF, Rahman P, Gladman DD, Griffiths CE, Reis A, Kere J, Duffin KC, Helms C, Goldgar D, Li Y, Paschall J, Malloy MJ, Pullinger CR, Kane JP, Gardner J, Perlmutter A, Miner A, Feng BJ, Hiremagalore R, Ike RW, Christophers E, Henseler T, Ruether A, Schrodi SJ, Prahalad S, Guthery SL, Fischer J, Liao W, Kwok P, Menter A, Lathrop GM, Wise C, Begovich AB, Genetic Analysis of Psoriasis Consortium; Onoufriadis A, Weale ME, Hofer A, Salmhofer W, Wolf P, Kainu K, Saarialho-Kere U, Suomela S, Badorf P, Hüffmeier U, Kurrat W, Küster W, Lascorz J, Mössner R, Schürmeier-Horst F, Ständer M, Traupe H, Bergboer JG, Heijer Md, van de Kerkhof PC, Zeeuwen PL, Barnes L, Campbell LE, Cusack C, Coleman C, Conroy J, Ennis S, Fitzgerald O, Gallagher P, Irvine AD, Kirby B, Markham T, McLean WH, McPartlin J, Rogers SF, Ryan AW, Zawirska A, Giardina E, Lepre T, Perricone C, Martín-Ezquerra G, Pujol RM, Riveira-Munoz E, Inerot A, Naluai AT, Mallbris L, Wolk K, Leman J, Barton A, Warren RB, Young HS, Ricano-Ponce I, Trynka G, Pellett FJ, Henschel A, Aurand M, Bebo B, Gieger C, Illig T, Moebus S, Jöckel KH, Erbel R, Wellcome Trust Case Control Consortium 2; Donnelly P, Peltonen L, Blackwell JM, Bramon E, Brown MA, Casas JP, Corvin A, Craddock N, Duncanson A, Jankowski J, Markus HS, Mathew CG, McCarthy MI, Palmer CN, Plomin R, Rautanen A, Sawcer SJ, Samani N, Viswanathan AC, Wood NW, Bellenguez C, Freeman C, Hellenthal G, Giannoulatou E, Pirinen M, Su Z, Hunt SE, Gwilliam R, Bumpstead SJ, Dronov S, Gillman M, Gray E, Hammond N, Jayakumar A, McCann OT, Liddle J, Perez ML, Potter SC, Ravindrarajah R, Ricketts M, Waller M, Weston P, Widaa S, Whittaker P, Nair RP, Franke A, Barker JN, Abecasis GR, Elder JT, Trembath RC (2012). Identification of 15 new psoriasis susceptibility loci highlights the role of innate immunity. Nature Genetics. 44: 1341-1348.
  7. Kadaja L, Eimre M, Paju K, Roosimaa M, Põdramägi T, Kaasik P, Pehme A, Orlova E, Mudist M, Peet N, Piirsoo A, Seene T, Gellerich FN, Seppet EK (2010). Impaired oxidative phosphorylation in overtrained rat myocardium. Experimental and Clinical Cardiology. 15: e116-e127.
  8. Saks V, Guzun R, Timohhina N, Tepp K, Varikmaa M. Monge C, Beraud N, Käämbre T, Kuznetsov A, Kadaja L, Eimre M, Seppet E (2010). Structure - function relationships in feedback regulation of energy fluxes in vivo in health and disease: Mitochondrial Interactosome. Biochimica et Biophysica Acta. 1797: 678-697.