Teadustöö
Teadustöö põhifookus
- Kirjeldada uusi energeetilise metabolismi ja endoplasmaatilise retiikulumi stressiga seotud patogeneetilisi radasid ning leida uusi geneetilisi võrgustikke ja patogeneesi molekulaarseid mehhanisme, mis osalevad luu- ja lihashaiguste (osteoporoos, osteoartriit, sarkopeenia) ning südamepuudulikkuse tekkes.
- Wfs-defitsiitsete hiirte uuringuid jätkates täpsustame nende lihaskonna proteoomi iseärasusi, paralleelselt analüüsisides ka nende südames ja skeletilihastes esinevaid transkriptsioonilisi muutusi ja patofüsioloogilisi ilminguid.
Peamised teadusgrandid
UT20-46 Luu- ja lihaspatoloogiate siirdeuuringud
Praegune olulisim koostöö
Eestis – Keemilise ja Bioloogilise Füüsika Instituut; Tartu Ülikooli Kliinikum, traumatoloogia ja ortopeedia kliinik
Rahvusvaheliselt – Hue Meditsiini ja Farmaatsia ülikool (Vietnam)
Andme- ja biomaterjali kogud
Koostöös Tartu Ülikooli Kliinikumi traumatoloogia ja ortopeedia kliinikuga sarkopeenia uurimisel projekti MYOAGE raames soetatud biomaterjalid inimese skeletilihasest.
Osteosarkoomi uuringute raames oleme kogunud 110 patisendi andmed ja bioloogilise materjali
Andmebaasid
Volframiini puudulikkusega hiirte südame- ja skeletilihase protoomika andmebaas ID PXD011019 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD011019
Viis olulisimat teadusartiklit viimasel viiel aastal
- 1Pääsuke, Reedik; Eimre, Margus; Piirsoo, Andres; Peet, Nadežda; Laada, Liidia; Kadaja, Lumme; Roosimaa, Mart; Pääsuke, Mati; Märtson, Aare; Seppet, Enn; Paju, Kalju (2016). Proliferation of human primary myoblasts is associated with altered energy metabolism in dependence of ageing in vivo and in vitro. Oxidative Medicine and Cellular Longevity, Article ID 8296150, 10 pages−x.10.1155/2016/8296150.
- Ivask, Marilin; Pajusalu, Sander; Reimann, Ene; Kõks, Sulev (2018). Hippocampus and Hypothalamus RNA-sequencing of WFS1-deficient Mice. Neuroscience, 374, 91−103.10.1016/j.neuroscience.2018.01.039.
- Lattekivi, Freddy; Koks, Sulev; Keermann, Maris; Reimann, Ene; Prans, Ele; Abram, Kristi; Silm, Helgi; Koks, Gea; Kingo, Kulli (2018). Transcriptional landscape of human endogenous retroviruses (HERVs) and other repetitive elements in psoriatic skin. Scientific Reports, 8, ARTN 4358.10.1038/s41598-018-22734-7.
- Eimre, Margus; Paju, Kalju; Peet, Nadežda; Kadaja, Lumme; Tarrend, Marian; Kasvandik, Sergo; Seppet, Joosep; Ivask, Marilin; Orlova, Ehte; Kõks, Sulev (2018). Increased Mitochondrial Protein Levels and Bioenergetics in the Musculus Rectus Femoris of Wfs1-Deficient Mice. Oxidative Medicine and Cellular Longevity, 1−12.10.1155/2018/3175313.
- Eimre, Margus; Kasvandik, Sergo; Ivask, Marilin; Kõks, Sulev (2018). Proteomic dataset of wolframin-deficient mouse heart and skeletal muscles. Data in Brief, 21, 616−619.10.1016/j.dib.2018.10.015.